MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 16043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004663	TAC	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004663	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004663	GGT	2	6	69	74	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004663	TTG	2	6	711	716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004663	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004663	CCTC	2	8	749	756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_004663	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004663	GAA	2	6	775	780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004663	ATTA	2	8	1808	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004663	TTAA	2	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004663	CTTT	2	8	2748	2755	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004663	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004663	ATA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004663	A	7	7	4003	4009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004663	AT	3	6	4037	4042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004663	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004663	AGA	2	6	4947	4952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004663	AAT	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004663	AGG	2	6	6767	6772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004663	GAAAC	2	10	7874	7883	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004663	AAG	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004663	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004663	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004663	CTG	2	6	8000	8005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004663	TTG	2	6	8931	8936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004663	A	6	6	8970	8975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004663	TAA	2	6	10159	10164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004663	ATT	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004663	TCT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004663	AT	3	6	14636	14641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004663	TAC	2	6	14696	14701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004663	TCTT	2	8	14724	14731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004663	ATT	2	6	14765	14770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004663	GCC	2	6	15429	15434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_004663	GAC	2	6	15439	15444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004663	T	7	7	15484	15490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004663	A	7	7	15511	15517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004663	A	7	7	16482	16488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004663	TC	3	6	16587	16592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004663	CAA	2	6	16603	16608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004663	CGG	2	6	16623	16628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004663	TA	3	6	18232	18237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004663	TGG	2	6	18977	18982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004663	AT	3	6	18986	18991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004663	TGA	2	6	19341	19346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004663	TATTTA	2	12	19352	19363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004663	AGTA	2	8	19389	19396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004663	GAA	2	6	19409	19414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004663	GCA	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004663	CGA	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004663	CTT	2	6	20525	20530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_004663	TA	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004663	TGC	2	6	20687	20692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004663	CAA	2	6	20737	20742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004663	A	7	7	20812	20818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004663	TGA	2	6	20842	20847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004663	AGT	2	6	20902	20907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004663	CTC	2	6	21374	21379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_004663	TCT	2	6	21396	21401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004663	CTTT	2	8	21414	21421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004663	TTCA	2	8	21457	21464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004663	GGA	2	6	21511	21516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004663	ATA	2	6	22114	22119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004663	A	6	6	22157	22162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004663	A	6	6	22201	22206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004663	TCTT	2	8	22238	22245	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004663	AGAA	2	8	22276	22283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004663	GGT	2	6	22337	22342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004663	T	6	6	22348	22353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004663	AAT	2	6	22424	22429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004663	TA	3	6	22445	22450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004663	TAA	3	9	22453	22461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004663	TAA	2	6	22476	22481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004663	GAAA	2	8	22497	22504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004663	AAATA	2	10	22509	22518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004663	A	6	6	22538	22543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004663	AT	3	6	22839	22844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004663	A	6	6	22850	22855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004663	AAT	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004663	ATCA	2	8	22880	22887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004663	TTC	2	6	28022	28027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004663	AAC	2	6	28042	28047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004663	ATT	2	6	28053	28058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004663	TCTT	2	8	28066	28073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004663	TC	3	6	29555	29560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004663	AAG	2	6	29561	29566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004663	TCAT	2	8	29625	29632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_004663	TTA	2	6	29633	29638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004663	GTC	2	6	29653	29658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004663	AGTT	2	8	30051	30058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004663	T	6	6	30061	30066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004663	CTAAA	2	10	30120	30129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004663	A	6	6	30148	30153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004663	A	6	6	30200	30205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004663	CT	3	6	30249	30254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004663	AGAGG	2	10	31514	31523	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004663	A	7	7	31538	31544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004663	AT	3	6	31546	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004663	TGGG	2	8	31562	31569	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004663	A	6	6	31573	31578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004663	AAT	2	6	31591	31596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004663	AGA	2	6	31613	31618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004663	A	6	6	31635	31640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004663	GTAAA	2	10	31658	31667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004663	AGA	2	6	31684	31689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004663	TCAT	2	8	31771	31778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004663	TTA	2	6	31787	31792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004663	T	6	6	31879	31884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004663	TTAC	2	8	31901	31908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_004663	CAAT	2	8	31920	31927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004663	ACA	2	6	32145	32150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004663	CCTT	2	8	32198	32205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_004663	AAG	2	6	32215	32220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004663	CAA	2	6	32257	32262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_004663	TGT	2	6	32265	32270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004663	GAA	2	6	32306	32311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004663	AGG	2	6	33552	33557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004663	ATT	2	6	33600	33605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004663	AAT	2	6	33673	33678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004663	GTC	2	6	33693	33698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004663	AAT	2	6	33768	33773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004663	AGA	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004663	TTA	2	6	33853	33858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004663	AG	3	6	33904	33909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004663	A	6	6	33931	33936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004663	T	6	6	33960	33965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004663	TAC	2	6	35169	35174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004663	T	8	8	35176	35183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004663	AGT	2	6	35198	35203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004663	TTTTA	2	10	35719	35728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004663	A	6	6	35796	35801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004663	CGAT	2	8	35820	35827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004663	TTCCT	2	10	35862	35871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_004663	A	7	7	35893	35899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004663	A	6	6	35925	35930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004663	TGT	2	6	35944	35949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004663	ATG	2	6	35970	35975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004663	TCG	2	6	36437	36442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004663	TTCT	2	8	36452	36459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_004663	GAA	2	6	42709	42714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004663	TAA	2	6	43663	43668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004663	CAG	2	6	44085	44090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004663	TAT	2	6	47559	47564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004663	ATTT	2	8	47638	47645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004663	T	6	6	47668	47673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004663	CAA	2	6	47695	47700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_004663	T	6	6	49997	50002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004663	GAT	2	6	55718	55723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004663	TAAA	2	8	55734	55741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004663	AAAG	2	8	55744	55751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004663	AGAAA	2	10	61607	61616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004663	TTGA	2	8	64263	64270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004663	CAGA	2	8	65569	65576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_004663	AAGG	2	8	65672	65679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_004663	A	7	7	65717	65723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004663	TTA	2	6	65724	65729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_004663	TTG	2	6	66829	66834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_004663	A	6	6	71570	71575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_004663	ATA	2	6	71609	71614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_004663	ATG	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_004663	AAT	2	6	71761	71766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_004663	TTG	2	6	71807	71812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004663	AGG	2	6	71906	71911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_004663	GTAT	2	8	72147	72154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_004663	A	6	6	72275	72280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_004663	AAT	2	6	72293	72298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_004663	A	6	6	72337	72342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_004663	T	6	6	72372	72377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_004663	AGA	2	6	72386	72391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_004663	TAGAGT	2	12	72421	72432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_004663	TTA	2	6	73149	73154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_004663	TCTT	2	8	90954	90961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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254	NC_004663	ATTT	2	8	102703	102710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_004663	T	7	7	102708	102714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_004663	A	6	6	102760	102765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_004663	TCT	2	6	103706	103711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_004663	A	6	6	103812	103817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_004663	AGTT	2	8	103826	103833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_004663	ATT	2	6	110570	110575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_004663	GAT	2	6	110989	110994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_004663	TA	3	6	111034	111039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_004663	TA	5	10	111042	111051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_004663	TAA	2	6	111175	111180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_004663	TC	3	6	111269	111274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_004663	AGC	2	6	111283	111288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_004663	GCT	2	6	111295	111300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_004663	T	6	6	111376	111381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_004663	GA	3	6	111387	111392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_004663	CT	3	6	111465	111470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_004663	CTCTT	2	10	111556	111565	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_004663	T	8	8	111603	111610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_004663	TTC	2	6	116963	116968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_004663	GTATG	2	10	116989	116998	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
288	NC_004663	TAG	2	6	117043	117048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_004663	A	7	7	117052	117058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_004663	CAA	2	6	117099	117104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_004663	TA	3	6	117197	117202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_004663	CGG	2	6	117234	117239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_004663	A	6	6	117278	117283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_004663	ATT	2	6	117412	117417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_004663	ATA	2	6	120360	120365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_004663	CTCTT	2	10	181317	181326	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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434	NC_004663	ATT	2	6	181344	181349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_004663	TAA	3	9	181495	181503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_004663	CTT	2	6	181744	181749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_004663	TA	3	6	181785	181790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_004663	GT	3	6	184650	184655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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